Jednym z największych wyzwań przy projektowaniu ołtarzy było – jak przyznaje ich autor Stanisław Niemczyk – odpowiednie zorganizowanie całej przestrzeni Błoń czy ogromnego obszaru Campusu Misericordiae i skupienie uwagi tłumów młodzieży na ołtarzu. – To będzie prezbiterium kościoła bez ścian – mówił, opowiadając o swoim projekcie.