Historia Nagrody Młodych Dziennikarzy zaczęła się niedługo po tym, jak student dziennikarstwa na Uniwersytecie Papieskim Jana Pawła II w Krakowie Bartek Zdunek zginął w wypadku. To właśnie jego imieniem nazwany został cały konkurs. Najpierw obejmował on „Debiut publicystyczny roku” oraz „Inicjatywę roku”. Potem dodano kategorię „Reportaż po debiucie”. Jej patronem został śp. Paweł Migas, który najpierw współpracował z krakowskim oddziałem „Gościa Niedzielnego”, a w 2006 roku pracował tu na etacie. W organizację konkursu włączył się „Gość Krakowski”, którego przedstawiciele od tego momentu zasiadają w kapitule nagrody.