W jednej z sal dawnego zajazdu Pod św. Benedyktem, bo takie miano nosił niegdyś budynek przy ul. Limanowskiego, można – łapiąc za mosiężny uchwyt – rozsunąć dwie połówki Krakusowego kopca i zobaczyć, co ma w środku. Górujący nad Podgórzem kopiec Kraka to prehistoria tego miejsca, podobnie jak niedaleki kościół św. Benedykta na Wzgórzu Lasoty, i od nich zaczyna się wystawowa narracja. W gablotach nie zabrakło też wcześniejszych mieszkańców tych okolic – amonitów oraz innych dewońskich i kredowych głowonogów. Ale to już historia zbyt odległa. Muzeum otwierane w roku jubileuszu wyzwolenia Polski w 1918 r. nawiązuje do tych czasów bezpośrednio.