Uroczystości pogrzebowe kard. Mariana Jaworskiego rozpoczęły się 10 września w kolegiacie św. Anny w Krakowie. Przy trumnie zmarłego hierarchy modliła się społeczność akademicka. Mszy św. w jego intencji przewodniczył abp Marek Jędraszewski, a homilię wygłosił biskup senior diecezji świdnickiej Ignacy Dec, który nazwał zmarłego kardynała średniowiecznym określeniem „ozdoba filozofów i książę teologii”. Biskup Dec podkreślał, że dla kard. Jaworskiego prawdy wiary były także prawdą filozofii, która „wyrasta z zadumy nad światem i nad człowiekiem”. – Dziękujemy Panu Bogu za ciebie, za to, co Bóg przez ciebie uczynił dla Kościoła, dla Krakowa, dla Polski, dla Ukrainy, dla polskiej nauki. Dziękujemy tobie za przykład ufnej, pokornej wiary i ogromnej wiedzy, która w połączeniu z wiarą była mądrością, którą nas obdarzałeś – mówił.