Jan Szkodoń urodził się 19 grudnia 1946 r. w Chyżnem, a Orawa i Podhale to była jego „rodno ziem”. W 1964 r. wstąpił do Krakowskiego Seminarium Duchownego. Święcenia kapłańskie otrzymał 22 marca 1970 r. w Jabłonce z rąk kard. Karola Wojtyły. Był wikariuszem w Makowie Podhalańskim oraz w parafii Matki Bożej Zwycięskiej w Krakowie-Borku Fałęckim.