Wpodziemiach bazyliki św. Franciszka z Asyżu w 1279 r. pochowano Bolesława Wstydliwego, księcia krakowskiego z rodu Piastów, który w 1257 r. dokonał lokacji Krakowa na prawie magdeburskim. Spoczywają tu także jego siostra – bł. Salomea (1211–1268), księżna halicka, pierwsza klaryska polska, oraz Stefan i Władysław – kilkuletni synowie księcia Władysława Łokietka, późniejszego króla Polski. Dobrodziejem klasztoru, który został pochowany w jego obrębie, był również Piotr Kochanowski (1566–1620), dworzanin królewski, bratanek poety Jana, sam zresztą świetny poeta.